魂斗罗归来哪个英雄好:騏驥生物聯手Waters公司正式推出首款視窗化的數據分析軟件 ——Qi MetA

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隨著多層次的組學包括代謝組學的研究展開,高通量的數據收集已經可以實現,但是與其他的組學學科相似,代謝組學的數據分析仍是個問題,但更大的問題是如何從龐大的數據中篩選出真正有價值的數據,以及代謝組學數據集到底意味著什么。因此數據的挖掘以及場景化分析已經成為各領域學者和用戶面對生物學研究,特別是代謝組學研究的最大瓶頸。

 

北京騏驥生物技術有限公司的數據處理團隊貼近質譜應用場景,根據數據分析的具體需求,研究質譜用戶的使用邏輯,開發出了Qi MetA數據分析軟件的一站式分析平臺。騏驥生物聯手Waters公司(沃特世公司紐約證券交易所代碼:WAT)正式推出這款視窗化的數據分析軟件。

Qi MetA軟件特色介紹

Qi MetA是一個視窗化的數據處理和分析軟件, 應用于代謝組學和臨床數據的分析,但功能也可以擴展到生物學數據分析和可視化的多個方面。適合于一站式代謝組學分析、臨床數據分析,以及單獨的生物學項目分析。它獨有的特點和功能主要包括:

首先,可以直接應用Waters公司Progenesis QI軟件導出的數據,直接進行處理,獲得可供分析的標準化數據;自動進行以質控樣本QC為標準的數據篩選,包括0值篩選,變異系數CV篩選和LOESS回歸校正,并自動提供樣本和QC的主成分分析(PCA)分布情況,從而對數據質量進行有效控制與評估;

其次,軟件不僅可以獲得單因素下兩組數據差異分析所有統計學指標,更可以進行多組的比較,得到整體的p值以及每兩組間的p值;

第三,Qi MetA針對單變量進行回歸分析,同時可以批量針對所有變量進行R2篩??;

第四,使用HMDB和LIPIDMAPS完整數據庫對化合物進行分類和比例變化分析;

第五,提供兩組或多組(正交)最小二乘法判別分析((O)PLS-DA)的快速切換;(O)PLS-DA 提供置換檢驗(permutation)結果以及交叉驗證功能(cross-validation)用以評判模型是否過擬合;

第六,通過VIP值、p 值、校正p值(FDR)及組間倍數變化(fold change)的閾值設定,一步法獲得潛在生物標志物;

第七,在軟件中,可以自動或者手動快速建立:邏輯回歸(logical regression),決策樹(decision tree),隨機森林(random forest),支持向量機(support vector machine),GBM(gradient boosting machine)以及Bagging模型;自動或者手動給出以上各種模型的ROC曲線以及模型評價參數;對潛在的生物標志物組合提供7種可選模型,并同時可以進行4種模型ROC和評價;

第八,Qi MetA針對不同場景,不僅可處理代謝組學和脂質組學等組學數據,同時也可以處理臨床數據和其他生物學數據;每次分析按照項目分類,歷史記錄查詢以及斷點工作繼續非常方便;瀏覽、處理、瀏覽、處理 …… 透明化的流程使結果更加可信。

Qi MetA軟件未來的發展:

Qi MetA軟件的發布,是我們事業的第一步,也是我們和Waters共同探索和挖掘數據價值的開始。未來,我們會在Qi Meta的數據分析平臺上,開發更多的場景化應用,更深入探究數據價值,提供更有效的數據解決方案,包括:

????第一,數據前處理的功能拓展,可以獨立于QI軟件進行數據前處理,包括峰對齊(peak alignment),峰注釋(peak annotation),化合物鑒定(compound?identification),個性化數據庫的建立等等。

第二,生物學功能的深入闡述。未來軟件不僅給出數據分析的結果,還最大程度的將其生物學意義進行闡述,例如進行信號通路分析(pathway analysis),讓用戶更便捷的掌握數據后面的科學意義。

第三,展開生物知識圖譜的研究。提供目標代謝物或者目標分子的相關信息擴展功能,當用戶通過一系列篩選得到目標化合物后,可以快速得到與該化合物相關的完整信息,有助于其下一步研究和應用的快速推進。

和waters公司的合作:

基因測序以及質譜分析作為能解釋“這是什么”的兩大工具已經深入到科學研究,特別是生物學研究的各個領域。Waters公司專注于為實驗室相關機構開發和生產先進的分析和材料科學技術。50多年來,Waters公司開發出一系列分離科學、實驗室信息管理、質譜分析和熱分析技術。Waters公司為高通量數據提供創造工具,同時也致力于推動質譜數據分析的不斷更新和進步。Qi MetA軟件無縫對接Waters的代謝組學工作,通過這次的合作,騏驥生物未來將攜手Waters服務全球更多的用戶,并推動組學數據分析更高效,更全面,更便捷。

總結:

在這成熟的金秋,騏驥生物收獲了豐碩的果實--Qi MetA軟件。Qi MetA 作為一款個性化的數據分析和挖掘軟件,得到了Waters公司的鼎力支持,以及同行、專家、學者的幫助,大家的認可和鼓勵,也給我們繼續向前的信心。通過這個數據平臺,我們未來有信心提高代謝病分析水平,更有效地進行疾病的早期檢測與臨床診斷,最終成為精準醫療和智能診斷的開拓和先驅者。